การทำงานของประตูเลื่อนอัตโนมัตินั้นสามารถทำงานได้โดยการสั่งปิดอัตโนมัติเมื่อระยะเวลาผ่านไปสักครู่ หรือ สามารถสั่งปิดประตูอัตโนมัติด้วยรีโมทควบคุมประตูเลื่อนอัตโนมัติ เป็นต้น โดยการควบคุมประตูเลื่อนอัตโนมัตินั้นจะสามารถทำได้ดีหากใช้ตัวรีโมทควบคุม เพราะจะมีหลากหลายรูปแบบที่สามารถสั่งให้ประตูเลื่อนทำงานได้ เช่น เปิด /ปิด/เปิดค้าง/เปิดครึ่งบาน